十四年前，初号机的觉醒仿佛是神祇降临，带来了近三冲击这一史无前例的浩劫，世界在这一瞬间被撕裂，万物俱焚，生灵涂炭。随之而来的，是葛城美里等NERV旧部头顶光环、背负着宿命，毅然出走成立了反抗势力Wille，誓言撼动以seele和NERV为首的压迫者。 Wille发号施令，将重任交给了明日香和真里，她们要夺回被困于卫星轨道的初号机和碇真嗣，然而却对真嗣设下了铁一般的禁令：绝不可让他再次接触初号机。真嗣在敌意环伺的阴霾中，心如浮萍，迷失于陌生的世界。最终，他在绫波丽的陪伴下，踏上了被九号机突袭的时空旅途，返回了那已满目疮痍的NERV总部。 在这破碎的城堡中，他意外重逢了梦中情人绫波，心中的思念如潮水奔涌。随着父亲的启示，他竟要与美少年渚薰共同驾驶那神秘的十三号机。十四年的空白化为一团混乱的迷雾，历史的巨轮碾压着真嗣的灵魂，情感的纠葛让他无从解脱。而他眼前看似温柔的渚薰，仿佛潜藏着不可告人的秘密，一层层剥开真相，竟是他未曾想象的惊涛骇浪…… 本片乃是EVA新剧场版四部曲的华丽第三章，命运的纤丝在此交织，未来的道路岂非荆棘密布。g